Процесс камеральной налоговой проверки деклараций по НДС централизован на федеральном уровне и автоматизирован.
На первом этапе система в автоматическом режиме проверяет контрольные соотношения показателей декларации по НДС.

В случаях обнаружения ошибок в адрес налогоплательщиков автоматически направляются требования о представлении пояснений. При этом основными нарушениями, выявленными по контрольным соотношениям, являются:

• несоответствие сумм по разделам налоговой декларации книгам покупок и продаж;
• в книгах покупок, продаж не указываются итоговые суммы;
• неверно указываются суммы НДС по счетам фактурам;
• неверно указываются коды операций в книгах покупок и продаж.